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NGS实验室建设原则与注意事项
发布时间:2021.07.22
信息摘要:
NGS实验室的建设原则可参考这一领域的李金明教授提出的一个原则,其称之为“16字方针”,即各区独立、注意风向、因地制宜、方便工作。

实验室建设

NGS技术是精准医学领域中一项非常关键的技术。精准诊断离不开分子诊断,而NGS技术是其中最难亦是应用最广的一项分子诊断技术。NGS技术相对比较复杂,需要一整套的系统工程才能完成,其中NGS实验室建设非常关键,也容易出现问题。

 

NGS实验室建设原则可参考这一领域的李金明教授提出的一个原则,其称之为“16字方针,即各区独立、注意风向、因地制宜、方便工作。前两个原则涉及如何设置,后两个原则则提醒注意不要走过头,应根据医院的实际情况,注意工作的方便,不拘泥于标准。这也是我提醒大家需要特别注意的第一点。目前各个医院对NGS技术的支持力度很大,但在建设NGS实验室时需注意总体面积不宜过大,以免能耗消耗非常大。此外,在实验室各区比例的设置上不要求平均比例,有的环节很小即可,有的环节可相对较大一些,即比例要合适。随着医院对NGS实验室的支持力度越大,要求也越为严格,但有些医院也出现走极端的情况,即分区非常多,房间数很多,但实际并不方便工作。应注意类似步骤的合并,设置适当的房间数。

 

第二点,需注意风向。其一,NGS实验室应使用全新风系统,而不能使用普通家用空调。新风系统可排出污染,而这是防污染最基础的设置。其二,需注意整个房间的气流方向应形成对流才有效。其三,目前出现问题较大的是生物安全柜、通风柜和超净工作台这三种设备的合理配置使用。对于样本的处理,需使用生物安全柜。生物安全柜通常使用A2级,不要太高级,30%外排即可满足基本需求。B2级过高,100%外排,其实并不是很合适。超净工作台除了在试剂准备间中可以使用外,其他地方不适宜使用。在所有环节中均使用超净工作台是不对的,因为超净工作台没有外排功能,如果DNA气溶胶一直在室内循环是不合适的。而有的单位为了重视起见,所有环节,包括文库构建都使用生物安全柜,实际上也没有必要。除了样本处理间,其他地方使用通风柜即可。

 

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