目前，我国在高校科研工作中投入了大量的人力、物力来支撑高校科学研究。但是在各专业实验室的使用和维护过程中，仍面临诸多困境，针对食品专业实验室建设方面，主要面临的困境有以下几个方面。

1. 食品专业实验室建设理念方面

随着社会经济的快速发展，对全面型人才的需求与日俱增，国家先后出台多项政策支持高校对科研型人才、创新型人才的培养，探索出多种培养方式。对于食品专业实验室建设，在建设理念上还存在依赖政策需求来定位实验室，而不是根据市场需求来确定实验室的问题。

2. 实验指导人员配备方面

各高校高度重视实验室建设的同时，对专业人才的缺乏问题也逐渐显现。大量引进高学历人才，强调较高的基础能力，却忽视了高学历人才基本是从学校理论直接跨进实验室领域，缺乏实践经验的事实，影响了实验室的工作效率。

3. 食品专业实验室设计和规划方面

大部分高校实验室在最初设计时都是为满足验证理论而设立的，其在设计和规划方面缺少调研，缺乏创新，更多的是完成现有理论的验证。另外，对于食品专业实验室建设，除了要做好位置选择和空间布局，还要做好平面设计。